В 1931 году согласно Постановлению Совета Народных Комиссаров РСФСР было начато строительство военного санатория в п. Курорт-Дарасун. К маю 1933 года было построено два деревянных спальных корпуса с 6-8-местными палатами, пищеблок, здание поликлиники, 3 дома для личного состава, здание паровой электростанции, радиоузел и подсобные складские помещения. До 1935 года санаторий функционировал только в летнее время, а с 1935 года по мере дальнейшего строительства, оснащения диагностической и лечебной аппаратурой, улучшения благоустройства санатория была организована круглогодичная работа.
В годы Великой Отечественной Войны наряду с соматическими больными, в санатории находились на долечивании офицеры после ранений. В послевоенные годы началось активное развитие санатория. В 1947 году было окончено строительство двухэтажного спального корпуса на 100 мест. С 1960 по 1977 год сданы в эксплуатацию: клуб на 315 мест, питьевой бювет, спальные корпуса с 2-х местными палатами на 206 и 26 мест, 36-ти и 80-ти квартирные дома для обслуживающего персонала, реконструирован лечебный корпус. В 80-х годах построено два пятиэтажных дома для работников санатория. В 1995 году закончилось строительство первой очереди спального корпуса на 150 мест с административным отделением. В санатории «Дарасунский» создана хорошая материально – техническая база, которая позволяет оказывать санаторно-курортные услуги в полном объеме на современном уровне в соответствии со стандартами санаторно-курортной помощи.
В соответствии с Приказом Министра обороны Российской Федерации от 29 декабря 2014 года № 983 с 15 мая 2015 года филиал «Санаторий «Дарасунский» включен в состав Федерального государственного казенного учреждения «Санаторно-курортный комплекс «Дальневосточный» Министерства обороны Российской Федерации.